Вследствие усилий многих поколений ученых в ДонНУЭТ сформировался мощный  научный потенциал в области экономики, торговли, оборудования и пищевых технологий.
Международного признания приобрели исследование научных школ по теории рынка, экономике и финансам торговли, бухгалтерского учета, анализа и аудиту; маркетинга и коммерческой деятельности, маркетингового менеджмента, оборудования пищевых производств, технологий питания, товароведения и экспертизы, эколого-технологичных проблем производства.

Последние четыре года университет признается Министерством образования и науки, молодежи и спорта Украины лучшим среди экономических университетов по научной деятельности.
Значительное внимание в университете отводится научному творчеству студентов. Ежегодно студенты ДонНУЭТ принимают участие в олимпиадах и фестивалях разных уровней, конкурсах дипломных проектов и научных работ, получая дипломы, грамоты, ценные подарки. Особенно одаренные и активные студенты получают стипендии Президента Украины, областной и городской госадминистрации и разных фондов.
Пять лет подряд ДонНУЭТ награждается кубком и  дипломом Всеукраинского конгресса профсоюзов как лучшее учебное заведение по организации научной работы среди студентов.
Подготовка ученых осуществляется в докторантуре по четырем специальностями и аспирантуре по 12 специальностям, защита докторских и кандидатских диссертаций по шести специальностям проходит в двух специализированных ученых советах.
За период работы в аспирантуре было подготовлено 47 докторов наук и защищено свыше 400 кандидатских диссертаций.
Университетом ежегодно издаются тематические сборники научных работ «Торговля и рынок Украины», «Оборудование и технологии пищевых производств», «Интеллект. Личность. Цивилизация», «Товароведение и инновации», которые входят в утвержденный ВАК Перечень научных изданий, в которых могут публиковаться основные результаты диссертационных работ, а также научный журнал «Вестник ДонНУЭТ» (серии: «Экономические науки», «Гуманитарные науки», «Технические науки»).
Научные работники университета работают экспертами комиссии Верховной Рады Украины, Кабинета Министров Украины, Министерства экономики, Высшей аттестационной комиссии; активно участвуют в разработке многих экономических законов, которые принимаются Верховной Радой. Весомым является взнос ученых университета в разработку Концепции развития внутренней торговли Украины и Программы научно-технического развития Донецкой области на период до 2020 года.