Унаслідок зусиль багатьох поколінь учених у ДонНУЕТ сформувався потужний  науковий потенціал у галузі економіки, торгівлі, обладнання та харчових технологій.
Міжнародного визнання набули дослідження наукових шкіл з теорії ринку, економіки та фінансів торгівлі, бухгалтерського обліку, аналізу й аудиту; маркетингу і комерційної діяльності, маркетингового менеджменту, обладнання харчових виробництв, технологій харчування, товарознавства та експертизи, еколого-технологічних проблем виробництва.

Останні чотири роки університет визнається Міністерством освіти і науки України кращим серед економічних університетів з наукової діяльності.
Значна увага в університеті приділяється науковій творчості студентів. Щорічно студенти ДонНУЕТ беруть участь в олімпіадах і фестивалях різних рівнів, конкурсах дипломних проектів і наукових робіт, одержуючи дипломи, грамоти, цінні подарунки. Особливо обдаровані й активні студенти отримують стипендії Президента України, обласної і міської держадміністрації та різних фондів.
П’ять років поспіль ДонНУЕТ нагороджується кубком і  дипломом Всеукраїнського конгресу профспілок як кращий навчальний заклад з організації наукової роботи серед студентів.
Підготовка вчених здійснюється в докторантурі за чотирма спеціальностями й аспірантурі за 12 спеціальностями, захист докторських і кандидатських дисертацій з шести спеціальностей відбувається у двох спеціалізованих учених радах.
За період роботи в аспірантурі було підготовлено 47 докторів наук і захищено понад 400 кандидатських дисертацій.
Університетом щорічно видаються тематичні збірники наукових праць «Торгівля і ринок України», «Обладнання та технології харчових виробництв», «Інтелект. Особистість. Цивілізація», «Товарознавство та інновації», які входять до затвердженого ВАК Переліку наукових видань, у яких можуть публікуватися основні результати дисертаційних робіт, а також науковий журнал «Вісник ДонНУЕТ» (серії: «Економічні науки», «Гуманітарні науки», «Технічні науки»).
Науковці університету працюють експертами комісії Верховної Ради України, Кабінету Міністрів України, Міністерства економіки, Вищої атестаційної комісії; беруть активну участь у розробці багатьох економічних законів, які приймаються Верховною Радою. Вагомим є внесок учених університету в розробку Концепції розвитку внутрішньої торгівлі України та Програми науково-технічного розвитку Донецької області на період до 2020 року.